醫師公會全聯會秘書長蔡明忠表示，
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，「自我藥療」涉及醫療行為與民眾健康，
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，不該由食藥署單方面推動，
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，而應提高層級，
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，由衛福部規劃，
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，食藥署、國健署、醫事司等單位共同研擬，才能確保用藥安全。且相關配套要做好，民眾須有一定的用藥認知，才能承擔自行買藥的風險。此外，蔡明忠說，在藥師「指示」下用藥定義模糊，若藥師針對民眾咳嗽、流鼻水等症狀，提出建議藥品，恐涉及醫療診斷行為，會違反醫療法。針對醫界的反對，新北市藥師公會理事長古博仁說，藥師提供諮詢協助，是告訴病患正確用藥知識、藥品副作用、注意事項，怎麼可能是診斷？這13項藥物，國外超市都買得到，安全無虞。民眾確實是需要教育，但別把大家當白痴，好像民眾無法自行購買簡易藥物。古博仁指出，自我藥療是希望減少健保資源浪費，不需要動不動就上醫院看病，各界應正向思考。劉麗玲強調，藥師僅提供諮詢，不是診斷。13項處方藥轉列指示藥，食藥署不會主動推動，而是由藥廠自行申請。會持續溝通協調，取得各界共識，並邀請醫師代表擔任指示藥及成藥諮議委員。，